تمتلك المنطقة الشرقية 6 موانئ رئيسية، أبرزها ميناء الملك عبد العزيز بالدمام كأكبر موانئ الخليج، وميناء الجبيل التجاري والصناعي، بقدرة استيعابية تتجاوز 100 مليون طن سنوياً. استقبل ميناء الملك عبد العزيز وحده 2.67 مليون حاوية في 2022، مع حركة سفن بلغت 2,167 سفينة.